Enfermedad de Crohn
El término enfermedad inflamatoria intestinal (EII) incluye dos trastornos de etiología desconocida, la colitis ulcerosa (CU) y la enfermedad de Crohn (EC) que se definen según criterios clínicos, radiológicos, endoscópicos e histológicos.
Ambas cursan de forma crónica con brotes de actividad inflamatoria.
La EC aunque también afecta muy a menudo al intestino grueso también es frecuente que afecte el tramo final del intestino delgado (ileon) y además, puede producir inflamación de cualquier zona del tubo digestivo desde la boca hasta el ano. La inflamación empieza con unas llagas que con el tiempo pueden ulcerarse y evolucionar a estrecheces de la pared del tubo digestivo o a fístulas, que a veces pueden atravesar todas sus capas y alcanzar otras estructuras cercanas.
Se calcula que en Europa existe un millón de personas con EC y casi un millón y medio con EII.
Las personas jóvenes entre los 25-40 años son las más propensas y, en general, suele afectar por igual a hombres y mujeres.
Síntomas
Suele cursar con periodos activos (brotes), alternando con fases asintomáticas (remisión). En algunas personas hay síntomas continuos (formas crónicas) a pesar de un tratamiento correcto.
Los síntomas digestivos dependerán de dónde esté localizada la enfermedad en el tubo digestivo y por tanto pueden ser muy variados.
En ciertos casos, casi no produce síntomas (por ejemplo, sólo anemia leve). Finalmente, a veces produce molestias del ano (llamadas enfermedad perianal), o formas agudas (perforación, abscesos en el abdomen).
Los síntomas de los brotes son variables, pero casi siempre incluyen diarrea, dolor abdominal y pérdida de peso. La diarrea es el principal, de heces mezcladas con sangre o moco y con mucha menos frecuencia de hemorragias por el ano. Es característico el dolor abdominal con retortijones, localizado alrededor del ombligo y en la parte inferior derecha del abdomen. Es frecuente la fiebre, y puede aparecer sangre en las heces. Se trata de síntomas crónicos que persisten más de 2-4 semanas.
El ano se afecta a veces con la aparición de bolsas de pus dolorosas (abscesos) o expulsión de pus por orificios alrededor del ano mismo (fístulas). Pueden aparecer síntomas dependientes de otros órganos (manifestaciones extraintestinales).
Cuando la enfermedad está en brote, aparecen alteraciones en los análisis: elevación de las pruebas de inflamación (velocidad de sedimentación, proteína C), anemia y otros. Entre estas alteraciones y lo que el paciente cuenta, el médico calcula la gravedad de cada brote lo que determina a su vez el tipo de tratamiento.
El algunas personas, el estrés, algunos fármacos y las infecciones intestinales, pueden desencadenar brotes.
Prevención
Si le han diagnosticado una EII, es muy importante que siga las medidas y recomendaciones que se indican a continuación y los tratamientos prescritos por su médico, ya que estos no sólo pueden disminuir el dolor sino también prevenir futuros brotes, así como evitar posibles complicaciones, mejorando el pronóstico de la enfermedad.
Recomendaciones:
- Vea a su médico si tiene frecuentes molestias intestinales, especialmente si tiene hemorragias anales.
- No tome medicamentos u otros productos no recomendados por su médico.
- Algunos pacientes que están siendo tratados con corticoides durante algún tiempo también pueden necesitar suplementos de calcio y vitamina D. Los pacientes anémicos también pueden necesitar suplementos de hierro y vitamina B12.
Heredabilidad de la Enfermedad de Crohn
e estima que la heredabilidad de la enfermedad de Crohn es del 50-60%. Esto significa que los factores genéticos contribuyen un poco más a las diferencias en el riesgo de esta enfermedad de lo que lo hacen los factores ambientales. Entre los factores genéticos que juegan un papel en la enfermedad de Crohn se incluyen los SNPs que se describen en este informe proporcionado.
Otros factores que pueden jugar un papel en la enfermedad de Crohn abarcan: factores ambientales, tendencia del cuerpo a reaccionar de forma exagerada ante flora bacteriana normal que se encuentra en los intestinos, y el tabaquismo, etc…
Sofaer (1993). “Crohn´s disease: the genetic contribution.”Gut34(7):869-71.
Genes relacionados con el desarrollo de Crohn
SNP : rs11209032
Gen o Región : 1p31.3
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs11209032 | GG | 0.77 |
El gen IL23R ha sido identificado como un gen asociado a múltiples enfermedades inflamatorias como la enfermedad de Crohn o la espondilitis anquilosante. De entre los SNPs asociados a estas condiciones se encuentra el rs11209032, que ha sido asociado a patologías como enfermedad de Crohn, espondilitis anquilosante, artritis reumatoide o enfermedad celiaca.
En concreto, para la enfermedad de Crohn, el odds ratio para el alelo de riesgo A (orientado según dbSNP) es de 1.3.
Glas J, Seiderer J, Wetzke M, Konrad A, Török HP, Schmechel S, et al. rs1004819 is the main disease-associated IL23R variant in German Crohn’s disease patients: Combined analysis of IL23R, CARD15, and OCTN1/2 variants. PLoS One. 2007;2(9):1–8.
SNP : rs1050152
Gen o Región : SLC22A4
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs1050152 | TC | 1.24 |
El polimorfismo rs1050152 se encuentra en el gen SLC22A4, que codifica para un transportador de cationes. Este SNP ha sido asociado con el riesgo de padecer ciertas enfermedades autoinmunes, como la enfermedad de Crohn. En concreto, el odds ratio para el alelo de riesgo rs1050152(T), orientado según dbSNP, es de 2.1 (CI: 1.31-3.39), calculado en un estudio de 203 casos y 200 controles.
Un SNP cercano, el rs2631367, localizado en la región promotora del gen SLC22A5, define un haplotipo junto con el rs3792873, reportando un odds ratio similar al anterior.
Peltekova VD, Wintle RF, Rubin L A, Amos CI, Huang Q, Gu X, et al. Functional variants of OCTN cation transporter genes are associated with Crohn disease. Nat Genet. 2004;36(5):471–5.
SNP : rs1004819
Gen o Región : IL23R
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs1004819 | GG | 1.26 |
El SNP rs1004819, localizado en el gen IL23R, se ha asociado a enfermedad de Crohn. Este gen codifica para una proteína que actúa como receptor para la interleucina 23 (IL-23), implicada en la vía de señalización JAK-STAT3 y muy importante en la respuesta inflamatoria. Estudios de asociación del genoma que pretendían identificar los factores genéticos que podrían contribuir a las enfermedades inflamatorias intestinales, han identificado una asociación significativa del gen ILR3 con estas.
La asociación más fuerte se encontró para el SNP rs1004819 con un OR para el alelo de riesgo (orientado según dbSNP) rs1004819 (A) de 1,56 (IC 1,37 a 1,78). En un estudio llevado a cabo en enfermos de Crohn, eL 93,2% de los portadores homocigotos AA en comparación con 78% de los portadores de tipo GG tenía implicación ileal.
Los estudios de replicación confirmaron asociaciones IL23R en cohortes independientes de pacientes con enfermedad de Crohn o colitis ulcerosa. Estos resultados y los estudios anteriores sobre el papel proinflamatorio de IL-23 priorizan esta vía de señalización como diana terapéutica en la enfermedad inflamatoria intestinal.
Glas J, Seiderer J, Wetzke M, Konrad A, Török HP, Schmechel S, et al. rs1004819 is the main disease-associated IL23R variant in German Crohn’s disease patients: Combined analysis of IL23R, CARD15, and OCTN1/2 variants. PLoS One. 2007;2(9):1–8.
Duerr RH, Taylor KD, Brant SR, Rioux JD, Silverberg MS, Daly MJ, et al. A genome-wide association study identifies IL23R as an inflammatory bowel disease gene. Science. 2006 Dec 1;314(5804):1461-3.
SNP : rs2201841
Gen o Región : IL23R
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs2201841 | AA | 0.75 |
El SNP rs2201841 es una variante intrónica que se encuentra localizada en el gen IL23R, que codifica para un receptor para la interleucina 23 implicado en la respuesta inmunitaria. Tal y como ya se ha descrito anteriormente, diversos SNPs localizados en este gen se han asociado con el riesgo de padecer enfermedad de Crohn.
Diversos estudios, como los estudios de asociación del genoma tipo GWAS, vinculan este SNP no solo con la enfermedad de Crohn sino también con la enfermedad de Graves o la psoriasis. En concreto, para la enfermedad de Crohn, el odds ratio estimado es de 1.52 (CI: 1.27-1.83).
Duerr RH, Taylor KD, Brant SR, Rioux JD, Silverberg MS, Daly MJ, et al. A genome-wide association study identifies IL23R as an inflammatory bowel disease gene. Science. 2006;314(5804):1461–3.
SNP : rs13361189
Gen o Región : 5q33.1
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs13361189 | TT | 0.92 |
El polimorfismo rs13361189 se encuentra localizado en el gen IRGM, que codifica para una enzima GTPasa implicada en la respuesta inmunitaria innata y la autofagia. Un estudio que incluyó a 557 pacientes con enfermedad de Crohn (EC), 425 pacientes con colitis ulcerosa (CU) y 672 controles españoles étnicamente emparejados, así como en otro meta-análisis realizado, se concluyó que el alelo C (orientado según dbSNP) estaba asociado a un mayor riesgo de padecer enfermedad de Crohn. En concreto, el riesgo se incrementaba 1.3 veces por cada alelo de riesgo portado.
Parkes M, Barrett JC, Prescott NJ, Tremelling M, Anderson C A, Fisher S A, et al. Sequence variants in the autophagy gene IRGM and multiple other replicating loci contribute to Crohn’s disease susceptibility. Nat Genet. 2007;39(7):830–2.
SNP : rs1992660
Gen o Región : 5p13.1
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs1992660 | TT | 1.28 |
El polimorfismo rs1992660 fue identificado en asociación con enfermedad de Crohn en un estudio de tipo GWAS. Es una variante localizada upstream al gen PTGER4 que codifica para el receptor de prostaglandinas E2 implicado en una variedad importante de procesos fisiológicos y patológicos.
En varias poblaciones europeas, el alelo más común, rs1992660 (T), orientado según dbSNP, se asoció con un mayor riesgo para la enfermedad de Crohn. Por el contrario, el odds ratio (agrupando varias poblaciones) para el alelo minoritario, rs1992660 (C), fue de 0.72 (IC: 0.60 a 0.86).
Franke A, Hampe J, Rosenstiel P, Becker C, Wagner F, Häsler R, et al. Systematic association mapping identifies NELL1 as a novel IBD disease gene. PLoS One. 2007;2(8).
SNP : rs11209026
Gen o Región : IL23R
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs11209026 | AG | 0.46 |
El SNP rs11209026 se encuentra localizado en el gen IL23R que codifica para un receptor específico de la interleucina 23 (IL-23). En cualquier respuesta inflamatoria, se liberan sustancias proinflamatorias, como la IL23 que promueven el proceso inflamatorio mediante la unión a sus receptores. Diversos estudios han confirmado la vinculación del gen IL23R y diversas enfermedades inflamatorias como la enfermedad de Crohn o la espondilitis anquilosante.
En concreto, este SNP confiere cierta protección frente a desarrollar enfermedad de Crohn tanto en la población judía askenazi como en la no judía. En concreto, el odds ratio para el alelo protector rs11209026(A), orientado según dbSNP, es de 0.43 (CI: 0.31 a 0.59).
The Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007;447(7145):661–78.
Duerr RH, Taylor KD, Brant SR, Rioux JD, Silverberg MS, Daly MJ, et al. A genome-wide association study identifies IL23R as an inflammatory bowel disease gene. Science. 2006 Dec 1;314(5804):1461-3.
Libioulle C, Louis E, Hansoul S, Sandor C, Farnir F, Franchimont D, et al. Novel Crohn disease locus identified by genome-wide association maps to a gene desert on 5p13.1 and modulates expression of PTGER4. PLoS Genet. 2007 Apr 20;3(4):e58.
SNP : rs1495965
Gen o Región : 1p31.3
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs1495965 | TT | 0.74 |
El SNP rs1495965 es uno de los muchos polimorfismos localizados en el gen IL23R que han mostrado asociación con enfermedades inflamatorias como la espondilitis anquilosante o la enfermedad de Crohn en un estudio a gran escala llevado a cabo en más de 1000 pacientes. Este gen ha sido identificado en múltiples estudios como factor de riesgo para la enfermedad inflamatoria intestinal.
En concreto, el odds ratio asociado al alelo de riesgo T (orientado según dbSNP) es 1.2. Algunos estudios asocian también a este SNP con la enfermedad de Behcet, un trastorno raro que causa inflamación en los vasos sanguíneos de todo el cuerpo.
Glas J, Seiderer J, Wetzke M, Konrad A, Török HP, Schmechel S, et al. rs1004819 is the main disease-associated IL23R variant in German Crohn’s disease patients: Combined analysis of IL23R, CARD15, and OCTN1/2 variants. PLoS One. 2007;2(9):1–8.
SNP : rs4958847
Gen o Región : 5q33.1
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs4958847 | GG | 0.89 |
El polimorfismo rs4958847 es un SNP localizado en el gen IRGM. Este gen codifica para una proteína GTPasa inducible por interferón implicada en la respuesta inmunitaria innata.
En un estudio de 507 pacientes con enfermedad de Crohn (EC), 475 pacientes con Colitis ulcerosa (CU) y 576 controles caucásicos de Nueva Zelanda, determinó que dicho polimorfismo rs4958847, estaba específicamente relacionado con la enfermedad de Crohn ileal pero no con otras formas de enfermedad inflamatoria intestinal. El odds ratio fue 1.77 (IC: 1.22-2.56).
En otro estudio en el que se incluyeron 557 pacientes con enfermedad de Crohn (EC), 425 pacientes con colitis ulcerosa (CU) y 672 controles españoles étnicamente emparejados, se concluyó que el alelo rs4958847(A) estaba asociado con el desarrollo de la enfermedad de Crohn (OR agrupado 1,31) y el desarrollo de la colitis ulcerosa (OR agrupado 1,13).
Roberts RL, Hollis-Moffatt JE, Gearry RB, Kennedy M A, Barclay ML, Merriman TR. Confirmation of association of IRGM and NCF4 with ileal Crohn’s disease in a population-based cohort. Genes Immun. 2008;9(6):561–5.
SNP : rs11465804
Gen o Región : IL23R
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs11465804 | GT | 0.56 |
El SNP rs11465804, localizado en el gen IL23R, que codifica para un receptor fundamental en la respuesta inflamatoria, ha sido identificado como un gen de susceptibilidad para la enfermedad inflamatoria intestinal (EII) y espondilitis anquilosante en un estudio amplio.
El odds ratio asociado a este polimorfismo, para el alelo G (orientado según dbSNP) es de 0.68, por lo que confiere cierto efecto protector.
Glas J, Seiderer J, Wetzke M, Konrad A, Török HP, Schmechel S, et al. rs1004819 is the main disease-associated IL23R variant in German Crohn’s disease patients: Combined analysis of IL23R, CARD15, and OCTN1/2 variants. PLoS One. 2007;2(9):1–8.
SNP : rs6601764
Gen o Región : 10p15.1
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs6601764 | TC | 0.97 |
El rs6601764 ha sido reportado como factor de riesgo para enfermedad de Crohn en un estudio a gran escala tipo GWAS. Estos estudios son de gran utilidad para la identificación de genes relacionados con enfermedades humanas comunes. Este SNP está localizado en una región intergénica.
En concreto, para este polimorfismo rs6601764, el alelo de riesgo (orientado según dbSNP) es C. Según el estudio GWAS, el odds ratio asociado con heterocigotos es 1.16 (IC 1.01-1.33), y para los homocigotos, 1.52 (IC 1.28-1.80).
The Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007;447(7145):661–78.
SNP : rs8111071
Gen o Región : RSPH6A
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs8111071 | AA | 0.94 |
Los estudios de tipo GWAS representan un enfoque de gran alcance para la identificación de genes implicados en enfermedades humanas más comunes. Al igual que otros SNPs previamente descritos, este rs8111071 ha sido asociado con la enfermedad de Crohn. Se encuentra localizado en el gen RSPH6A que codifica para una proteína con el mismo nombre que forma parte de los axonemas de los flagelos.
Para este polimorfismo, el alelo de riesgo (orientado según dbSNP) es rs8111071 (G). El odds ratio asociado con heterocigotos es 1.47 (IC 1.25-1.73), y para los homocigotos, 1.28 (IC 0.56-2.88).
The Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007;447(7145):661–78.
SNP : rs7517847
Gen o Región : IL23R
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs7517847 | GG | 0.61 |
La interleucina (IL-23) es un regulador clave de la inflamación influyendo en la actividad de los linfocitos T. Diversos estudios indican que las variantes localizadas en el receptor de esta IL23, el IL23R, juegan un papel importante en la susceptibilidad a padecer enfermedad de Crohn.
De entre todas las variantes presentes el en gen IL23R identificadas en estudios GWAS, se incluye el rs7517847, para el que se asigna un odds ratio de 1.61 para el alelo de riesgo G (orientado según dbSNP). Además de los estudios de tipo GWAS, este SNP se ha asociado a enfermedad de Crohn en otros muchos.
Franke A, Hampe J, Rosenstiel P, Becker C, Wagner F, Häsler R, et al. Systematic association mapping identifies NELL1 as a novel IBD disease gene. PLoS One. 2007;2(8).
SNP : rs7807268
Gen o Región : 7q36.1
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs7807268 | CC | 1.11 |
El SNP rs7807268 es una variante intergénica identificada como factor de riesgo de enfermedad de Crohn en un estudio de tipo GWAS. Cada vez hay más pruebas de que este tipo de estudios representan un enfoque de gran alcance para la identificación de genes implicados en enfermedades humanas más comunes.
Para el polimorfismo rs7807268, el alelo de riesgo (orientado según dbSNP) es G. El odds ratio asociado con los heterocigotos es 1.38 (IC 1.20-1.60), y para los homocigotos, 1.47 (IC 1.24-1.74).
The Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007;447(7145):661–78.
SNP : rs1793004
Gen o Región : NELL1
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs1793004 | CG | 0.93 |
El SNP rs1793004 es un polimorfismo localizado en el gen NELL1, que codifica para la proteína de unión a la proteína quinasa NELL1 implicada en la regulación del crecimiento celular. Este SNP ha sido asociado a la enfermedad de Crohn en un estudio de tipo GWAS.
En varias poblaciones europeas, el alelo más común, rs1793004 (C), se asoció con un mayor riesgo para la enfermedad de Crohn. Por el contrario, el odds ratio (agrupados en varias poblaciones) para el alelo minoritario G, orientado según dbSNP, fue de 0.89 (IC: 0.69 a 1.14), por lo que confiere cierto efecto protector.
Franke A, Hampe J, Rosenstiel P, Becker C, Wagner F, Häsler R, et al. Systematic association mapping identifies NELL1 as a novel IBD disease gene. PLoS One. 2007;2(8).
SNP : rs9469220
Gen o Región : 6p21.32
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs9469220 | AG | 0.93 |
El polimorfismo rs9469220, localizado en una región intergénica del cromosoma 6, se ha asociado con la enfermedad de Crohn en estudios tipo GWAS llevados a cabo en más de 14,000 casos y en meta-análisis derivados de los mismos.
Para este polimorfismo, el alelo de riesgo (orientado según dbSNP) es rs9469220 (A). El odds ratio asociado con heterocigotos es 1.14 (IC 0.98-1.32), y para los homocigotos, 1.52 (IC 1.28-1.79).
The Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007;447(7145):661–78.
SNP : rs10489629
Gen o Región : IL23R
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs10489629 | CC | 1.38 |
El rs10489629 es uno de los SNP localizados en el gen IL23R que ha sido relacionado con la susceptibilidad a padecer diversas enfermedades de carácter autoinmune, como la enfermedad de Crohn, artritis reumatoide o la espondilitis anquilosante. Tal y como se ha descrito, este gen, codifica para un receptor de citoquinas implicado en la señalización de la respuesta inflamatoria.
En el estudio que permitió la identificación de este polimorfismo como factor de riesgo se analizó el ADN de 2.670 individuos caucásicos, incluyendo 833 pacientes con enfermedad de Crohn, 456 pacientes con colitis ulcerosa y 1.381 controles sanos no relacionados, para 10 polimorfismos localizados en IL23R. El odds ratio para el alelo T (orientado según dbSNP) es 0.83.
Glas J, Seiderer J, Wetzke M, Konrad A, Török HP, Schmechel S, et al. rs1004819 is the main disease-associated IL23R variant in German Crohn’s disease patients: Combined analysis of IL23R, CARD15, and OCTN1/2 variants. PLoS One. 2007;2(9):1–8.
SNP : rs7753394
Gen o Región : 6q23.3
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs7753394 | TC | 1 |
La variante de localización intergénica rs7753394 ha sido identificada como factor de riesgo para la enfermedad de Crohn en un estudio de tipo GWAS.
Para este polimorfismo, el alelo de riesgo (orientado según dbSNP) es rs7753394 (C). El odds ratio asociado con heterocigotos es 1.21 (IC 1.04-1.40), y para los homocigotos 1.48 (IC 1.25-1.76).
The Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007;447(7145):661–78.
SNP : rs1992662
Gen o Región : 5p13.1
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs1992662 | AA | 0.85 |
El polimorfismo rs1992662 es un SNP localizado upstream al gen PTGER4, que codifica para un receptor de prostaglandinas implicado en múltiples funciones fisiológicas y patológicas. Este SNP se identificó en un estudio de asociación del genoma que relacionándose con la enfermedad de Crohn.
En varias poblaciones europeas, el alelo más común, rs1992662 (A), orientado según dbSNP, se asoció con un mayor riesgo para la enfermedad de Crohn. Por el contrario, el odds ratio (agrupados en varias poblaciones) para el alelo minoritario, rs1992662 (G), fue de 0,76 (IC: 0,63 a 0,91).
Franke A, Hampe J, Rosenstiel P, Becker C, Wagner F, Häsler R, et al. Systematic association mapping identifies NELL1 as a novel IBD disease gene. PLoS One. 2007;2(8).
SNP : rs9858542
Gen o Región : BSN
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs9858542 | AG | 0.97 |
El SNP rs9858542 se encuentra localizado en el gen BSN que codifica para una proteína de andamiaje que participa en la organización del citoesqueleto presinaptico. Este polimorfismo ha sido asociado a la enfermedad de Crohn en un estudio tipo GWAS.
Para este polimorfismo rs9858542, el alelo de riesgo (orientado según dbSNP) es (A). El odds ratio asociado con heterocigotos es 1.09 (IC 0.96-1.24), y para los homocigotos, 1.84 (IC 1.49-2.26).
The Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007;447(7145):661–78.
SNP : rs12037606
Gen o Región : 1q24.3
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs12037606 | AG | 1.02 |
La variante intergénica rs12037606 fue identificada como factor de riesgo para la enfermedad de Crohn en un estudio de tipo GWAS, que suponen una herramienta muy útil para la identificación de genes implicados en enfermedades humanas más comunes.
Para este polimorfismo, el alelo de riesgo (orientado según dbSNP) es (A). El odds ratio asociado a los heterocigotos es 1.22 (IC 1.07-1.40), y para los homocigotos 1.52 (IC 1.28-1.82).
The Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007;447(7145):661–78.
SNP : rs2542151
Gen o Región : 18p11.21
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs2542151 | TT | 0.91 |
El SNP rs2542151 ha sido reportado como factor de riesgo para la enfermedad de Crohn en un estudio tipo GWAS. Este polimorfismo está localizado en el gen PTPN2 que codifica para una tirosina-fosfatasa implicada en variedad de procesos como crecimiento, diferenciación, ciclo celular, etc.
Para el polimorfismo rs2542151, el alelo de riesgo (orientado según dbSNP) es G. El odds ratio asociado a los heterocigotos es 1.3 (IC: 1.14-1.48), y para los homocigotos, 2.01 (IC 1.46-2.76).
The Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007;447(7145):661–78.
SNP : rs6596075
Gen o Región : 5q31.1
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs6596075 | CC | 1.08 |
Cada vez hay más pruebas de que los estudios de asociación de todo el genoma (GWAS) representan un enfoque de gran alcance para la identificación de genes implicados en enfermedades humanas más comunes. En un estudio de este tipo se identificó el SNP rs6596075 como factor de riesgo para la enfermedad de Crohn.
Este SNP se encuentra localizado en el gen IBD5 que codifica para un transportador de ergotioneina. En concreto, para el rs6596075, el alelo de riesgo (orientado según dbSNP) es C. El odds ratio asociado a los heterocigotos es 1.55 (IC: 1.00-2.39) y para los homocigotos es de 2.09 (IC: 1.35-3.14).
The Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007;447(7145):661–78.
SNP : rs2076756
Gen o Región : NOD2
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs2076756 | AG | 1.27 |
El SNP rs2076756 se asoció a la enfermedad de Crohn en un estudio de tipo GWAS. Se encuentra localizado en el gen NOD2 que gen codifica para una proteína conocida como dominio reclutador de caspasa 15, que juega un importante papel en la respuesta inmunitaria y apoptosis. Varios polimorfismos de este gen se han relacionado con la enfermedad de Crohn.
En muchas poblaciones europeas, el alelo minoritario rs2076756(G), orientado según dbSNP, se asocia con un aumento del riego de padecer enfermedad de Crohn. En concreto, el odds ratio estimado es de 1,71 (IC: 1,42 a 2,05).
Franke A, Hampe J, Rosenstiel P, Becker C, Wagner F, Häsler R, et al. Systematic association mapping identifies NELL1 as a novel IBD disease gene. PLoS One. 2007;2(8).
SNP : rs10889677
Gen o Región : IL23R
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs10889677 | CC | 0.57 |
El SNP rs10889677 se encuentra localizado en el gen IL23R que codifica para un receptor específico de la interleucina 23 (IL-23). En cualquier respuesta inflamatoria, se liberan sustancias proinflamatorias, como la IL23 que promueven el proceso inflamatorio mediante la unión a sus receptores. Diversos estudios han confirmado la vinculación del gen IL23R y diversas enfermedades inflamatorias como la enfermedad de Crohn o la espondilitis anquilosante. En concreto, el odds ratio para el alelo de riesgo rs10889677(C), orientado según dbSNP, es de 1.3.
Glas J, Seiderer J, Wetzke M, Konrad A, Török HP, Schmechel S, et al. rs1004819 is the main disease-associated IL23R variant in German Crohn’s disease patients: Combined analysis of IL23R, CARD15, and OCTN1/2 variants. PLoS One. 2007;2(9):1–8.
SNP : rs17221417
Gen o Región : NOD2
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs17221417 | GC | 1.09 |
El polimorfismo rs17221417 fue identificado como factor de riesgo de enfermedad de Crohn en un estudio de tipo GWAS. Este SNP está localizado en el gen NOD2, que codifica para una proteína que desempeña un papel muy importante en la respuesta inflamatoria.
El alelo de riesgo es G (orientado según dbSNP). En este caso, el odds ratio para los heterocigotos es de 1.29 (CI: 1.13-1.46) y para los homocigotos, 1.92 (CI: 1.58-2.34).
The Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007;447(7145):661–78.
SNP : rs10210302
Gen o Región : 2q37.1
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs10210302 | TT | 1.38 |
La variante rs10210302, localizada en el gen ATG16L1, fue identificada como factor de riesgo asociado a enfermedad de Crohn en un estudio de tipo GWAS. Este gen codifica para una proteína implicada en el proceso de autofagia. Además, estudios de farmacogenética han determinado que este SNP está también relacionado con la eficacia en la respuesta al fármaco adalimumab, utilizado en el tratamiento de la enfermedad de Crohn.
En concreto, para el polimorfismo rs10210302, el alelo de riesgo (orientado según dbSNP) es (T). El odds ratio asociado con heterocigotos es 1,19 (IC 1,01-1,41), y para los homocigotos, 1,85 (IC 1,56-2,21).
The Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007;447(7145):661–78.
SNP : rs1343151
Gen o Región : IL23R
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs1343151 | GA | 0.89 |
El SNP rs1343151 es uno de los muchos polimosfismos localizados en el gen IL23R que han mostrado asociación con enfermedades inflamatorias como la espondilitis anquilosante o la enfermedad de Crohn en un estudio a gran escala llevado a cabo en más de 1000 pacientes. Este gen ha sido identificado en múltiples estudios como factor de riesgo para la enfermedad inflamatoria intestinal.
En concreto, el odds ratio asociado a este polimorfismo fue de 0.8 para el alelo A (orientado según dbSNP).
Glas J, Seiderer J, Wetzke M, Konrad A, Török HP, Schmechel S, et al. rs1004819 is the main disease-associated IL23R variant in German Crohn’s disease patients: Combined analysis of IL23R, CARD15, and OCTN1/2 variants. PLoS One. 2007;2(9):1–8.
SNP : rs3197999
Gen o Región : MST1
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs3197999 | GA | 1.06 |
El SNP rs3197999 se encuentra localizado en el gen MST1, que codifica para la proteína estimulante de macrófagos (MSP), implicada en la regulación de la respuesta inmunitaria.
Este SNP se identificó como variante de riesgo en un estudio de asociación de tipo GWAS. En concreto, en odds ratio para el alelo de riesgo rs3197999(A), orientado según dbSNP, se estimó en 1.2.
El mecanismo de acción no está del todo claro, pero se cree que la variante de riesgo altera la secuencia de la proteína y este cambio podría afectar a la forma en la que esta interacciona con los receptores de las células del sistema inmunitario, sobre todo a nivel intestinal.
Barrett JC, Hansoul S, Nicolae DL, Cho JH, Duerr RH, Rioux JD, et al. Genome-wide association defines more than 30 distinct susceptibility loci for Crohn’s disease. Nat Genet. 2008;40(8):955–62.
Goyette P, Lefebvre C, Ng A, Brant SR, Cho JH, Duerr RH, et al. Gene-centric association mapping of chromosome 3p implicates MST1 in IBD pathogenesis. Mucosal Immunol. 2008 Mar;1(2):131-8.
SNP : rs17234657
Gen o Región : 5p13.1
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs17234657 | TT | 0.87 |
Cada vez hay más pruebas de que los estudios de asociación de todo el genoma (GWAS) representan un enfoque de gran alcance para la identificación de genes implicados en enfermedades humanas más comunes. El SNP intergénico rs17234657 ha sido identificado como factor de riesgo para la enfermedad de Crohn en un estudio de este tipo.
En concreto, el alelo de riesgo (según dbSNP) es rs17234657(G). Concretamente, el odds ratio asociado con los heterocigotos es 1.54 (CI: 1.34-1.76) y para los homocigotos, 2.32 (CI: 1.59-3.39).
The Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007;447(7145):661–78.
Libioulle C, Louis E, Hansoul S, Sandor C, Farnir F, Franchimont D, et al. Novel Crohn disease locus identified by genome-wide association maps to a gene desert on 5p13.1 and modulates expression of PTGER4. PLoS Genet. 2007 Apr 20;3(4):e58.
SNP : rs1800972
Gen o Región : DEFB1
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs1800972 | GG | 1.34 |
Tres SNP del gen DEFB1 (rs11362, rs1800972 y rs1799946) fueron analizados en un estudio mediante genotipado (taqman® y RFLP) en 190 pacientes con enfermedad de Crohn y 95 casos control. Este gen codifica para la beta-defensina, una proteína microbicida y citotóxica fabricada por los neutrófilos y asociada con inflamación crónica.
Se observó que los SNP rs1800972 y rs11362 mostraban una fuerte asociación con las formas de colon e ileocolónicas de la enfermedad, y no se detectó ninguna asociación con la forma ileal. Estos resultados indican que las variaciones genéticas en el gen DEFB1, puede estar asociadas con el riesgo para la enfermedad de Crohn y puede determinar fenotipo de la enfermedad.
Kocsis AK, Lakatos PL, Somogyvári F, Fuszek P, Papp J, Fischer S, et al. Association of beta-defensin 1 single nucleotide polymorphisms with Crohn’s disease. Scand J Gastroenterol. 2008;43(3):299–307.
SNP : rs10761659
Gen o Región : 10q21.2
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs10761659 | AA | 1.24 |
Cada vez hay más pruebas de que los estudios de asociación de todo el genoma (GWAS) representan un enfoque de gran alcance para la identificación de genes implicados en enfermedades humanas más comunes.
El polimorfismo rs10761659 ha sido identificado en un estudio de este tipo como factor de riesgo para la enfermedad de Crohn. En concreto, el alelo de riesgo G (orientado según dbSNP) presenta un odds ratio asociado para heterocigotos de 1.23 (IC 1.05-1.45), y para los homocigotos, 1.55 (IC 1.3-1.84).
The Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007;447(7145):661–78.
SNP : rs2066844
Gen o Región : NOD2
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs2066844 | CC | 0.91 |
La variante rs2066844, también conocida como c.2104C>T o p.Arg702Trp, se encuentra localizada en el gen NOD2. Este gen codifica para una proteína conocida como dominio reclutador de caspasa 15, que juega un importante papel en la respuesta inmunitaria y apoptosis. Varios polimorfismos de este gen se han relacionado con la enfermedad de Crohn.
El mecanismo por el cual este polimorfismo (y otros localizados en el mismo gen) se vinculan a la enfermedad de Crohn se desconoce pero se postula que las versiones de mayor riesgo de los SNPs dan lugar a proteínas que no logran unirse correctamente a determinados ligandos o que se unan a otros diferentes. Estos errores pueden implicar cambios en la señalización de la respuesta inmunitaria.
The Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007;447(7145):661–78.
Hugot JP, Chamaillard M, Zouali H, Lesage S, Cézard JP, Belaiche J, et al. Association of NOD2 leucine-rich repeat variants with susceptibility to Crohn´s disease. Nature. 2001 May 31;411(6837):599-603.
Rioux JD, Xavier RJ, Taylor KD, Silverberg MS, Goyette P, Huett A, et al. Genome-wide association study identifies new susceptibility loci for Crohn disease and implicates autophagy in disease pathogenesis. Nat Genet. 2007 May;39(5):596-604.
SNP : rs1000113
Gen o Región : 5q33.1
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs1000113 | CC | 0.9 |
Cada vez hay más pruebas de que los estudios de asociación de todo el genoma (GWAS) representan un enfoque de gran alcance para la identificación de genes implicados en enfermedades humanas más comunes. La variante rs1000113 se ha asociado con el riesgo de padecer enfermedad de Crohn en un estudio de este tipo. Se encuentra localizada en el gen IRGM, miembro de la familia de las GTPasas inducibles por interferón, implicadas en la respuesta inmunitaria innata.
El alelo de riesgo (orientado según dbSNP) es rs1000113 (T). El odds ratio asociado a portadores heterocigotos es de 1,54 (IC 1,31-1,82) y para los homocigotos 1,92 (IC 0,92-4,00).
The Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007;447(7145):661–78.
SNP : rs6908425
Gen o Región : CDKAL1
| SNP UTILIZADO | GENOTIPO | ODDS RATIO * AJUSTADO |
|---|---|---|
| rs6908425 | TC | 0.9 |
Cada vez hay más pruebas de que los estudios de asociación de todo el genoma (GWAS) representan un enfoque de gran alcance para la identificación de genes implicados en enfermedades humanas más comunes. Nuevamente en un estudio de este tipo, se ha identificado el SNP rs6908425 como factor de riesgo para la enfermedad de Crohn. Se encuentra localizado en el gen CDKAL1 que codifica para una metiltiotransferasa cuya función no está del todo clara aunque se cree que podría estar involucrada en la ruta de señalización de p53, entre otras.
En concreto, para este polimorfismo, el alelo de riesgo (orientado según dbSNP) es rs6908425 (C). El odds ratio estimado asociado con heterocigotos es 1.63 (IC 1.38-2.25), y para los homocigotos, 1.95 (IC 1.43-2.67).
Barrett JC, Hansoul S, Nicolae DL, Cho JH, Duerr RH, Rioux JD, et al. Genome-wide association defines more than 30 distinct susceptibility loci for Crohn’s disease. Nat Genet. 2008;40(8):955–62.
